Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RargP18911 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RargP18911 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RargP18911 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RargP18911 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RargP18911 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RargP18911 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RargP18911 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms