Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms