Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms