Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrphP15331 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrphP15331 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrphP15331 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrphP15331 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrphP15331 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrphP15331 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrphP15331 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrphP15331 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrphP15331 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrphP15331 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrphP15331 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrphP15331 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrphP15331 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrphP15331 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrphP15331 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PrphP15331 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrphP15331 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrphP15331 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrphP15331 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrphP15331 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrphP15331 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrphP15331 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrphP15331 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrphP15331 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms