Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf1P15314 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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