Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DmdP11531 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DmdP11531 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DmdP11531 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DmdP11531 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DmdP11531 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DmdP11531 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DmdP11531 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DmdP11531 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DmdP11531 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DmdP11531 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DmdP11531 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DmdP11531 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DmdP11531 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DmdP11531 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DmdP11531 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DmdP11531 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DmdP11531 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DmdP11531 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DmdP11531 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DmdP11531 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DmdP11531 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DmdP11531 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DmdP11531 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DmdP11531 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DmdP11531 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
DmdP11531 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DmdP11531 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DmdP11531 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DmdP11531 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms