Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa1P11477 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms