Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RaraP11416 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RaraP11416 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RaraP11416 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RaraP11416 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RaraP11416 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RaraP11416 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RaraP11416 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RaraP11416 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RaraP11416 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RaraP11416 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RaraP11416 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RaraP11416 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RaraP11416 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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