Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PolP11369 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PolP11369 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PolP11369 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PolP11369 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
PolP11369 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolP11369 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolP11369 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolP11369 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolP11369 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolP11369 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolP11369 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PolP11369 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP11369 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolP11369 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolP11369 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolP11369 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolP11369 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolP11369 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolP11369 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolP11369 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolP11369 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PolP11369 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PolP11369 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PolP11369 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PolP11369 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PolP11369 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms