Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms