Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms