Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Egr1P08046 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Egr1P08046 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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