Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spta1P08032 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spta1P08032 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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