Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SparcP07214 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SparcP07214 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SparcP07214 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SparcP07214 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SparcP07214 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SparcP07214 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SparcP07214 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SparcP07214 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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SparcP07214 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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SparcP07214 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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SparcP07214 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SparcP07214 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SparcP07214 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SparcP07214 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SparcP07214 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SparcP07214 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SparcP07214 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms