Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gap43P06837 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gap43P06837 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gap43P06837 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gap43P06837 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gap43P06837 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gap43P06837 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gap43P06837 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gap43P06837 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gap43P06837 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gap43P06837 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms