Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Me1P06801 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Me1P06801 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Me1P06801 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Me1P06801 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Me1P06801 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Me1P06801 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Me1P06801 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Me1P06801 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Me1P06801 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Me1P06801 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Me1P06801 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Me1P06801 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Me1P06801 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Me1P06801 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Me1P06801 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Me1P06801 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Me1P06801 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Me1P06801 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Me1P06801 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Me1P06801 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Me1P06801 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Me1P06801 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Me1P06801 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Me1P06801 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Me1P06801 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Me1P06801 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Me1P06801 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Me1P06801 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Me1P06801 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Me1P06801 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Me1P06801 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms