Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06336 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06336 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06336 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1302.6 ms