Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01647 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01647 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01647 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms