Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01645 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01645 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01645 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01645 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01645 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01645 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01645 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01645 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01645 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01645 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01645 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01645 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01645 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01645 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01645 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms