Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01644 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01644 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01644 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01644 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01644 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01644 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01644 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01644 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01644 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01644 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01644 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01644 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01644 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01644 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01644 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01644 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01644 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01644 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01644 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms