Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01643 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01643 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01643 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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