Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms