Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnkO88874 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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CcnkO88874 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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