Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms