Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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BckdkO55028 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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