Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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