Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms