Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffaO54786 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffaO54786 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DffaO54786 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DffaO54786 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DffaO54786 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DffaO54786 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DffaO54786 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DffaO54786 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DffaO54786 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DffaO54786 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DffaO54786 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DffaO54786 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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