Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CrxO54751 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CrxO54751 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrxO54751 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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