Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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