Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1baO35930 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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