Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stag2O35638 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stag2O35638 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag2O35638 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms