Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx1aO35526 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms