Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edil3O35474 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Edil3O35474 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms