Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc18a3O35304 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms