Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms