Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nedd9O35177 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nedd9O35177 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nedd9O35177 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nedd9O35177 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nedd9O35177 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nedd9O35177 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nedd9O35177 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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