Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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