Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms