Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms