Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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