Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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