Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm37995-201ENSMUST00000194958 1714 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Tprkb-205ENSMUST00000113753 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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