Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms