Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8356J3QPD3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8356J3QPD3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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