Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms