Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms