Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms