Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcdh9F8VPK8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms