Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crocc2F6XLV1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms